盟军方面

高级统帅与战略决策层：

1. 道格拉斯·麦克阿瑟 - 盟军西南太平洋战区总司令，整个菲律宾战役的总指挥，誓言“我会回来”的践行者。

2. 富兰克林·罗斯福 - 美国总统，支持麦克阿瑟重返菲律宾的战略。

3. 切斯特·威廉·尼米兹 - 美国太平洋舰队总司令，为战役提供海军支援。

美军地面部队指挥官：
4. 沃尔特·克鲁格 - 美国第6集团军司令，负责吕宋岛登陆及主要地面作战的总指挥。
5. 奥斯卡·格里斯沃尔德 - 第14军军长，负责中央平原战线，直指马尼拉。
6. 伊努埃尔·M·斯威夫特 - 第1军军长，负责北部山区战线，与山下奉文主力在碧瑶山区鏖战。
7. 罗伯特·S·贝特勒 - 第11军军长（战役后期加入），负责肃清比科尔半岛等地区。
8. 约瑟夫·斯温 - 第6集团军副司令。
9. 维恩·D·马奇 - 第14军副军长。

美军师级关键指挥官：
10. 威廉·C·蔡斯 - 第1骑兵师（“飞驰师”）指挥官，率先突入马尼拉市，解救圣托马斯集中营。
11. 奥森·D·拉斯科 - 第37步兵师师长，参与马尼拉激战，特别是攻占因特拉穆罗斯古城。
12. 莱昂纳德·F·温 - 第40步兵师师长，负责清除巴丹半岛和科雷希多岛。
13. 查尔斯·L·马林斯 - 第43步兵师师长，参与中央平原和吕宋北部的战斗。
14. 詹姆斯·L·布拉德利 - 第38步兵师师长，负责向吕宋东北部推进。
15. 阿奇博尔德·V·阿诺德 - 第6步兵师师长，在吕宋北部山区进行艰苦战斗。
16. 霍华德·M·特纳 - 第32步兵师师长，同样在北线作战。
17. 埃德温·D·帕特里克 - 第6步兵师副师长，在战斗中阵亡，是美军阵亡级别最高的指挥官之一。

美军航空与后勤支援指挥官：
18. 乔治·C·肯尼 - 美国陆军第5航空队司令，提供压倒性的空中支援。
19. 威廉·B·凯西 - 西南太平洋战区工兵负责人，负责修复港口和基础设施。

美军海军与两栖部队指挥官：
20. 托马斯·C·金凯德 - 美国第7舰队司令，负责整个登陆舰队的运输、掩护和火力支援。
21. 丹尼尔·E·巴比 - 第7舰队两栖部队司令，直接指挥林加延湾大规模登陆。
22. 杰西·B·奥尔登多夫 - 战列舰和巡洋舰编队指挥官，为登陆提供强大的舰炮火力。

菲律宾游击队与盟军合作者：
23. 拉塞尔·W·福尔克纳曼 - 美军派往菲律宾的情报官员，负责协调与游击队的行动。
24. 爱德华多·M·阿巴亚 - 吕宋岛北吕宋军区游击队重要指挥官。
25. 马卡里奥·佩拉尔塔 - 菲律宾中吕宋地区游击队重要领导人。

日本方面

高级统帅与战略决策层：
26. 山下奉文 - 日本第14方面军司令官，吕宋岛防御总指挥，制定“振武作战”计划（放弃滩头，退守山区持久战）。
27. 武藤章 - 第14方面军参谋长，山下的主要助手。
28. 寺内寿一 - 南方军总司令（山下奉文的上级），驻守西贡。
29. 东条英机 - 日本前首相兼陆军大臣，对菲律宾防御战略有前期影响。

日军军级指挥官：
30. 横山静雄 - 第41军司令官，负责马尼拉地区及吕宋中南部防御。
31. 塚田理喜智 - 第1挺进集团（空降兵）司令。

日军师团与守备队关键指挥官：
32. 岩渊三次 - 马尼拉海军防卫队司令。他是马尼拉大屠杀和城市毁灭的主要责任人，违抗山下奉文“放弃马尼拉”的命令，率海军部队死守，导致惨烈巷战。
33. 尾崎止戈夫 - 第8师团师团长，在吕宋北部的卡加延河谷作战。
34. 鲤登行一 - 第23师团师团长，在吕宋北部山区作战。
35. 三浦房纪 - 第2坦克师团师团长，参与中央平原的装甲战。
36. 小林修 - 第58独立混成旅团长。
37. 冈本德 - 第10师团师团长（部分部队在吕宋）。
38. 有末精三 - 负责后勤与兵站。

日军海军指挥官（在吕宋岛）：
39. 大川内传七 - 西南方面舰队司令（海军），其下属部队与岩渊三次一起死守马尼拉和科雷希多岛。

亲日菲律宾政权：
40. 何塞·帕西亚诺·劳雷尔 - 日本扶植的菲律宾第二共和国总统，驻在马尼拉直至美军逼近。